7 sep 2007 13:30
Onderdeel: Wageningen Universiteit
Locatie: Aula, gebouw 362, Gen. Foulkesweg 1, Wageningen
Organisatie: Wageningen Universiteit
Promotor: Prof.dr.ir. M. Koornneef (Erfelijkheidsleer)
Promotor: Prof.dr. L.H.W. van der Plas (Plantenfysiologie)
Co-Promotor: Dr. D. Vreugdenhil
Voor veel eigenschappen van planten en dieren kan in de natuur
erfelijke variatie worden gevonden. De genetische regulatie van zulke
eigenschappen is vaak complex door de bijdrage van vele genen. De
modelplant Arabidopsis thaliana (zandraket) is uiterst geschikt om de
complexe regulatie van deze eigenschappen op te helderen door gebruik
te maken van de natuurlijke variatie binnen deze soort. Behalve
variatie in fysiologische eigenschappen wordt er ook vaak variatie
gevonden in de mate van het tot expressie komen van genen en in de
ophoping van metabolieten (inhoudsstoffen). Deze variatie kan
tegenwoordig efficiënt geanalyseerd worden door gebruik te maken van
zogenaamde 'omics' technologieën (de gelijktijdige analyse van vele,
zo niet alle, leden van een bepaalde klasse van biologische
moleculen). Het ophelderen van regulerende processen die de expressie
van genen beïnvloeden maakt de identificatie van gen-tot-gen
regulatie en uiteindelijk de constructie van regulatoire netwerken
mogelijk. Wij analyseerden de expressie van genen van het volledige
genoom (transcriptomics) en vonden genetische regulatie voor meer dan
4000 genen. Bovendien konden we een aantal gen-tot-gen interacties
voorspellen die de constructie van een regulatoir netwerk mogelijk
maakten. Daarnaast analyseerden we de aanwezigheid van honderden
metabolieten (metabolomics) en ontdekten dat voor de meesten de
gevonden variatie verklaard kon worden door genetische factoren.
Titel proefschrift: "Genetical Genomics in Arabidopsis: from natural
variation to regulatory networks"
Zie het origineel
Directe internet uitzending van de promotie
Wageningen Universiteit