Bacterial response to ecological opportunities offered by soil fungi
Datum: 04 december 2009
Promotie: J.A.S. Warmink, 14.45 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: Bacterial response to ecological opportunities offered
by soil fungi
Promotor(s): prof.dr. J.D. van Elsas
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Reactie bacteriën op ecologische mogelijkheden geboden door
bodemschimmels
Voor de vruchtbaarheid van de grond is het microbiële leven heel
belangrijk. Het microbiële bodemleven is betrokken bij de
belangrijkste biochemische cycli, vooral bij de afbraak van organisch
materiaal tot nieuwe voedingsstoffen voor planten en andere
organismen. Dit maakt de studie van dit deel van de microbiologie
interessant voor de landbouw. Maar, vanwege de diversiteit van het
bodemleven is het tevens een intrigerend onderzoeksobject voor de
fundamentele (micro)biologie. Jan Warmink richtte zijn
promotieonderzoek voornamelijk op het beter begrijpen van de
interactiemechanismen tussen bacteriën en schimmels, die binnen de
microbiële gemeenschap in de grond een zeer belangrijke rol spelen.
Eén van de potentiële mechanismen om als bacterie te kunnen profiteren
van de schimmelgastheer kan het zogenaamde `type III secretion system'
(TTSS) zijn. Veel bacteriële ziekteverwekkers bij plant, dier en mens
maken gebruik van dit mechanisme voor de infectie van hun gastheer.
Warmink ontdekte dat er een verhoudingsgewijze significante toename
van TTSS-positieve bacteriën was onder invloed van een schimmel. Deze
vondst geeft aan dat bacteriën met het TTSS in het voordeel zijn ten
opzichte van bacteriën zonder dit mechanisme. Daardoor kon hij ook
aantonen dat TTSS een rol kan spelen in interacties tussen bacterie en
schimmel, wat tot nu toe onbekend was. Bacteriën kunnen ook gebruik
maken van schimmeldraden voor verplaatsing door de bodem. Deze
eigenschap is uitermate belangrijk voor de vitaliteit van het
bodemleven, omdat nuttige bacteriën via deze weg verspreid kunnen
worden. Er zijn sterke aanwijzingen gevonden dat het TTSS een rol
speelt in deze verplaatsing.
Jan Warmink (Gieten, 1978) studeerde Plantbiotechnology aan de
Wageningen Universiteit. Zijn promotieonderzoek deed hij aan de
Rijksuniversiteit Groningen, bij de vakgroep Microbiële ecologie van
het Centre for Ecological en Evolutionary Studies (CEES). Inmiddels
werkt hij als wetenschappelijk medewerker bij Sylphium Life Sciences
in Groningen.
Laatst gewijzigd: 20 november 2009 11:08
Rijksuniversiteit Groningen