Radboud Universiteit Nijmegen
Radboud Universiteit doet mee in giga-project kankergenen (Nature)
Datum bericht: 15 april 2010
Een internationaal netwerk van 177 onderzoeksinstituten gaat vijftig
kankergenomen ontrafelen. Op 15 april presenteert het International
Cancer Genome Consortium (ICGC) zich in het tijdschrift Nature. Binnen
dit netwerk gaat moleculair bioloog Henk Stunnenberg van de Radboud
Universiteit Nijmegen samen met Britse onderzoekers de genetische code
van borstkanker in kaart brengen. 'Een echte uitdaging.'
Opeenstapeling van DNA-fouten
Kanker ontstaat niet van de ene op de andere dag. Er is een
opeenstapeling voor nodig van fouten in het erfelijke
materiaal. Britse onderzoekers ontdekten afgelopen herfst dat iemand
met longkanker maar liefst 23.000 DNA-fouten heeft. Het International
Cancer Genome Consortium (ICGC) gaat nu ook vijftig andere
kankersoorten zo grondig in kaart brengen.
Kankercellen versus normale cellen
Elke groep onderzoekers uit onder meer China, Japan, Canada, Europa,
Korea, India, Singapore, én Nijmegen gaat één kankertype
bestuderen en daarbinnen de cellen van minimaal vijfhonderd
patiënten. De wetenschappers gaan de kankercellen van patiënten
vergelijken met hun normale cellen. Ze kijken niet alleen naar het
genoom, het erfelijk materiaal in de kankercel, maar ook naar
afgeleiden daarvan zoals de eiwitexpressie en de transcriptie van DNA
naar RNA. Op die manier kunnen de fouten in de zieke cellen heel
precies in kaart worden gebracht.
Henk Stunnenberg, hoogleraar Moleculaire biologie bij het NCMLS
(Nijmegen Centre for Molecular Life Sciences) van de Radboud
Universiteit maakt deel uit van een groep die borstkankercellen gaat
analyseren. Stunnenberg neemt de DNA-methylering voor zijn rekening.
DNA-methylering is een chemische verandering die ervoor zorgt dat een
stukje genoom wel of juist niet wordt afgelezen. In een kankercel is
de methylering verstoord, waardoor de kenmerken van de cel veranderen
en een kankercel kan ontstaan.Â
Grote waarde voor behandelingÂ
Stunnenberg vindt het ICGC een heel mooi en ambitieus project. 'We
praten over 25.000 kankergenomen die volledig ontsleuteld gaan worden,
de totale hoeveelheid informatie die verwerkt moet worden is 25.000
keer het humane genoom. Een megaproject als dit kun je niet doen met
een handvol mensen, omdat het een dimensie is die vele malen groter is
dan de dimensie van alle genomen die tot nu toe in kaart gebracht
zijn.'
Het in kaart brengen van de kankergenen is van grote waarde voor de
behandeling van de ziekte. 'Op dit moment krijgen patiënten in de
praktijk niet altijd de goede behandeling', zegt Henk Stunnenberg. 'Ze
krijgen bijvoorbeeld een heel agressieve bestralingskuur terwijl een
hormoontherapie voor hen voldoende zou kunnen zijn.'
(Bron VOX)