Quantitative proteomics of Saccharomyces cerevisiae vacuoles and stress
responses in Lactococcus lactis
Datum: 10 mei 2010
Promotie: mw. E. Wiederhold, 16.15 uur, Academiegebouw, Broerstraat 5,
Groningen
Proefschrift: Quantitative proteomics of Saccharomyces cerevisiae
vacuoles and stress responses in Lactococcus lactis
Promotor(s): prof.dr. D.J. Slotboom, prof.dr. B. Poolman
Faculteit: Wiskunde en Natuurwetenschappen
Meten hoe de hoeveelheid eiwit verandert in de tijd
Organismen zijn opgebouwd uit diverse soorten moleculaire bouwstenen.
Het complete arsenaal van ieder type molecuul wordt aangeduid met het
achtervoegsel `-ome'. Voorbeelden zijn genome (DNA), transcriptome
(RNA), lipidome (lipiden), metabolome (metabolieten) en proteome
(eiwitten). De eerste stap in een analyse van het proteome van een
organisme is vast te stellen welke eiwitten er op een bepaald tijdstip
aanwezig zijn. Een dergelijke analyse geeft een statische momentopname,
die niet volstaat om de dynamiek van organismen te begrijpen. Daartoe
is het nodig om ook te meten hoe de hoeveelheid van ieder eiwit
verandert in de tijd, bijvoorbeeld als gevolg van externe signalen, of
veroudering. In dit proefschift worden enkele studies beschreven waarin
bepaald is hoeveel eiwit aanwezig is op een bepaald tijdstip en hoe de
hoeveelheden veranderen in de tijd. Op deze manier is vastgesteld welke
eiwitten zich in de vacuole van gist bevinden, en hoe de bacterie
Lactococcus lactis reageert als het organisme gebruikt wordt om
menselijk CFTR (het eiwit dat taaislijmziekte veroorzaakt als het niet
goed functioneert) te produceren.
Elena Wiederhold (Kyrgyzstan, 1976) studeerde biologie in Tübingen. Het
onderzoek werd uitgevoerd bij de afdeling biochemie van de RUG.
Wiederhold gaat verder in het onderzoek als postdoc aan de University
of Zurich.
Laatst gewijzigd: 03 mei 2010 13:33
Rijksuniversiteit Groningen