Publicaties Leidse onderzoekers Skubak en Annu veelvuldig geciteerd
Nieuwe publicaties over software van Pavol Skubak en Navraj Pannu zijn
de eerste drie maanden meer dan honderd maal geciteerd. Het aantal
citaties zal waarschijnlijk snel toenemen.
Macromoleculen visualiseren in 3D
De software van Skubak en Pannu toont macromoleculaire structuren op
atoomniveau.
Pavol Skubak en Navraj Pannu ontwikkelen en implementeren algoritmes en
verspreiden hun software kosteloos. De software is ontwikkeld voor
röntgenkristallografie. Deze technologie stelt wetenschappers in staat
om macromoleculaire structuren op atoomniveau te visualiseren.
Â
Met deze mate van detaillering kunnen wetenschappers begrijpen hoe
moleculen interacteren en hoe enzymen hun functies uitvoeren. Hierdoor
kunnen nieuwe medicijnen worden ontwikkeld. De onderzoekers van het
Leiden Institute of Chemistry ontwikkelen en implementeren nieuwe
algoritmes waarmee wetenschappers gemakkelijker driedimensionale
moleculaire structuren kunnen onderscheiden.
CCP4 software zonder winstoogmerk
Het werk in Acta Crystallographica D beschrijft programma's van de CCP4
softwaresuite. Skubak en Pannu implementeren hun algoritmes in deze
suite, die een set programma's omvat die vaak voor eiwitkristallografie
worden gebruikt. CCP4 is een non-profit-organisatie die workshops
organiseert om jonge onderzoekers met deze nieuwe methoden vertrouwd te
maken. In de toekomst willen Skubak en Pannu in Leiden CCP4-workshops
gaan houden, in aanvulling op trainingsworkshops in China, India en de
VS, waarin zij al participeren.
Pannu erkend als veel geciteerd chemicus
Uit eerder onderzoek bleek al dat Pannu een van 's werelds meest
geciteerde chemici is. Het werk van Skubak en Pannu, dat wordt
gefinancierd door de Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk
Onderzoek (NWO), zal de ratings van beide onderzoekers ongetwijfeld
verder doen stijgen. Pannu zegt: 'Er is nog steeds ruimte voor verdere
verbeteringen en we zullen doorgaan met het ontwikkelen van methodes om
de toepassing van kristallografie voor het visualiseren van steeds
grotere structuren te bevorderen.â
Hoge citatiegraad
In april waren de onderzoekers co-auteurs van een artikel over hun
onderzoek, dat werd gepubliceerd in het tijdschrift Acta
Crystallografica D. Twee papers waarbij Skubak en Pannu betrokken
waren, zijn al respectievelijk 68 en 36 keer geciteerd. Het laatste van
de twee vervangt een paper dat al 7.338 keer is geciteerd en naar
verwachting zal dat in de toekomst nog veel vaker gebeuren.
Universiteit Leiden