GLAUCUS PROTEOMICS B.V
Glaucus Proteomics gaat verbintenis aan met supercomputingcentrum SARA
en GigaPort voor de ontwikkeling van geavanceerde technologieen voor
analyse van het humane proteoom
Utrecht, Nederland - Glaucus Proteomics BV heeft vandaag bekendgemaakt
dat er overeenkomsten zijn gesloten met twee Nederlandse bedrijven:
SARA, een van de grootste supercomputing-faciliteiten in Europa, en
GigaPort, een volgende generatie internet-initiatief dat een
state-of-the-art breedband-netwerk levert. Deze overeenkomsten zullen
de biocomputing capaciteit en connectiviteit leveren benodigd voor de
ontwikkeling van nieuwe 'high throughput' tools en technieken voor
proteomische analyse, en voor snelle screening van
kandidaat-geneesmiddelen (antilichamen en kleine moleculen) met
verbeterde specificiteit.
Eiwitten vormen de belangrijkste functionele bouwstenen van cellen, en
te begrijpen hoe eiwitten functioneren en hoe hun betrokkenheid bij
ziekte is, vormt een van de belangrijkste uitdagingen waarvoor de
biowetenschappen zich vandaag de dag gesteld zien. De analyse van
eiwitten is gecompliceerd en daarom ontwikkelt Glaucus Proteomics een
nieuwe serie producten en technieken, zoals eiwit- en
antilichaam-biochips die deze opdracht uitvoeren met een hoge
verwerkingssnelheid en een hoge gevoeligheid.
'Genomics en proteomics veranderen het zoeken naar nieuwe
geneesmiddelen in een informatiegestuurde wetenschap. Om de oorzaken
van menselijke ziekten te kunnen begrijpen en geneesmiddelen te
ontwikkelen is high-performance computing van essentieel belang en
dient dit daarom integraal deel uit te maken van de
ondernemingsstrategie van Glaucus Proteomics,' verklaarde Prof. Ian
Humphery-Smith, Chief Scientific Officer van Glaucus Proteomics. 'Deze
verbintenis met SARA en GigaPort is van groot belang, want zij kunnen
ons de deskundigheid en infrastructuur leveren die nodig is voor onze
IT-intensieve taak via een uitbesteed, kostenbesparend en betrouwbaar
model.'
Door deze verbintenissen wordt Glaucus Proteomics een integraal
onderdeel van het SARA supercomputing-systeem. Volgens de voorwaarden
van de overeenkomst zal Glaucus Proteomics:
- De capaciteit gebruiken van de SGI Origin 3800: TERAS, de nationale
supercomputing-faciliteit van Nederland. TERAS is een 1024
CPU-systeem, dat bestaat uit twee SGI Origin 3800 512 CPU-systemen met
een maximale prestatie van 1 Tflop (1012 floating points bewerkingen)
per seconde en een aantal andere high-performance
computing-oplossingen.
- Gebruik maken van reeds geoptimaliseerde en onmiddellijk functionele
software, waardoor een anders langdurige vertragingsfase wordt
vermeden die samenhangt met het operationeel maken van nieuwe
hardware.
- Versneld assistentie ontvangen van topkwaliteit met parallel code
optimalisatie.
-Toegang verkrijgen tot remote data back-up infrastructuur elders in
Nederland.
-Remote systeembeheer krijgen voor de interne computingbehoeften van
Glaucus Proteomics.
- Door de extreme bandbreedte van het GigaPort-netwerk (SURFnet5)
worden verbonden met SARA. Er is een eigen dual optic-dark fiber
glasvezellijn naar het dichtstbijzijnde GigaPort knooppunt. Er is op
dit moment een verbinding van 1 Gigabit per seconde, die verder zal
worden uitgebreid naar 10 Gigabit per seconde. SURFnet5 wordt
beschouwd als een van de meest geavanceerde onderzoeksnetwerken ter
wereld.
'SARA zal een belangrijke en aanvullende rol spelen als servicecentrum
en leverancier van bioinformatica van hoge kwaliteit,' zei Dr. Anwar
Osseyran, Managing Director van SARA Computing and Networking Services
in zijn commentaar. 'Vandaag de dag worden buitengewoon grote
hoeveelheden gegevens geproduceerd in de biowetenschappen. Het
omzetten van gegevens in kennis en inzicht vereisen grote prestaties
op het gebied van supercomputing en geavanceerde
visualisatietechnieken, wat een eerste vereiste was voor de
samenwerking met Glaucus Proteomics, om snelle kennisontwikkeling in
proteomica te realiseren. Dat wij in staat zijn deze diensten te
leveren is reeds aangetoond door de succesvolle inzet en ondersteuning
die wij leveren voor de nationale supercomputer van Nederland en de
inzet en de ondersteuning ten behoeve van het GigaPort
high-performance onderzoeksnetwerk, een van de snelste
onderzoeksnetwerken ter wereld.'
Door deze overeenkomsten kan Glaucus Proteomics de specificiteit en
kruisreactiviteit van zijn verzameling volledig menselijke
antilichamen in detail vaststellen. Deze antilichamen zijn een
essentieel onderdeel van de antilichaam-arrays die momenteel worden
ontwikkeld bij Glaucus Proteomics en die het ontdekken en opsporen van
menselijke eiwitten (het proteoom) die in verband staan met gezondheid
en ziekte mogelijk maken. Glaucus Proteomics zal tevens
biomarker-patronen vaststellen. Naar wordt verwacht zijn deze nuttig
voor de samenstelling van geneesmiddelen die geschikter zijn voor
afzonderlijke personen dan voor populaties.
Omtrent SARA
Vanaf de oprichting in 1971 heeft SARA zich ontwikkeld tot een
nationaal expertisecentrum op het gebied van supercomputing,
grootschalige netwerken en infrastructuurvoorzieningen. SARA
ondersteunt wetenschap en bedrijven met de verwerking van uiterst
rekenintensieve taken en het visualiseren van complexe gegevens voor
fundamenteel en toegepast wetenschappelijk onderzoek. Daarbij valt te
denken aan weersvoorspellingen, milieuonderzoek, klimaatmodellering,
stromingsmodellen, theoretische chemie en fysica.
In 1985 kreeg SARA de verantwoordelijkheid voor de huisvesting en het
systeembeheer van de Nederlandse nationale supercomputer, die wordt
gefinancierd door de Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk
Onderzoek (NWO). SARA verzorgt ook de huisvesting en het beheer van
een groot aantal andere supercomputers van Nederlandse universiteiten.
Sinds de start van het SURFnet IP-netwerk in 1989 is SARA
verantwoordelijk voor het technische en operationele beheer van dit
breedband-netwerk voor de Nederlandse universiteiten,
wetenschapscentra en onderwijsinstellingen. Vanaf het prille begin is
SARA nauw betrokken geweest bij de internetontwikkelingen in
Nederland.
In 1996 is SARA geselecteerd als een van de vier locaties voor de
huisvesting en ondersteuning van de Amsterdam Internet Exchange
(AMS-IX), een van de grootste internetknooppunten van Europa. SARA
biedt faciliteiten voor de huisvesting en het systeembeheer van vele
internet-serviceproviders (ISP's) en telecom-operators (Telcos) die
zijn verbonden met de AMS-IX. Omtrent GigaPort
GigaPort is een initiatief van de Nederlandse overheid in samenwerking
met het hoger onderwijs en onderzoek en het bedrijfsleven. Het doel
van het initiatief is het scheppen van de mogelijkheid voor Nederland
om een leidende rol te vervullen in de ontwikkeling en het gebruik van
de meest geavanceerde innovatieve internettechnologieën en aldus bij
te dragen tot de volgende generatie internet. Dit project bestaat uit
twee delen, GigaPort-Netwerk and GigaPort-Applicaties.
SURFnet is een van de partners in het GigaPort-project en is
verantwoordelijk voor het GigaPort-netwerk. De SURFnet backbone
(SURFnet5) heeft verbindingen van 10 Gigabit per seconde. Tevens
verzorgt deze backbone internationale verbindingen met Europa met
snelheden van tenminste 2,5 Gbit per seconde en transatlantische
verbindingen van tenminste 2 Gbit per seconde, die in nauwe
samenwerking worden uitgevoerd met gelijksoortige initiatieven in het
buitenland en die bekend staan als de 'volgende generatie
internetprojecten'. SURFnet5 omvat verbeterde netwerktoegang door het
gebruik van nieuwe technieken zoals Fiber to the Home en wireless
diensten.
Het GigaPort-Applicaties project creëert een omgeving waarin het
onderwijsveld, onderzoekscentra en bedrijven nieuwe ICT-toepassingen
kunnen ontwikkelen en testen. De onderzoeksthema's zijn onder meer
elektronische handel, elektronisch samenwerken, elektronische
kennisontsluiting en middleware-technologieën. Op deze gebieden wordt
kennis gegenereerd die wordt toegepast in concrete projecten, samen
met bedrijven, onderwijsinstellingen, ziekenhuizen, enz.
GigaPort-Applicaties wordt gerealiseerd door het Telematica
Instituut.
Omtrent Glaucus Proteomics
Glaucus Proteomics is een biotechnologisch bedrijf dat een nieuwe
generatie antilichamen en proteomics-technologieën ontwikkelt voor een
versnelde en optimale ontwikkeling van geneesmiddelen en behandeling
van ziekten. Het bedrijf richt zich in eerste instantie op het gebruik
van eiwit-array's voor een snelle screening van therapeutische
kandidaat-geneesmiddelen, daarbij de kans op klinisch succes
vergrootend. In april 2001 heeft het bedrijf een samenwerkingsverband
gesloten met Medarex en GenMab voor het gebruik van de HuMAb Mouse
voor het genereren van menselijke antilichamen. Door de specificiteit
en de kruisreactiviteit van deze antilichamen te bepalen, kan Glaucus
Proteomics snel eiwitten die een rol vervullen bij gezondheid en
ziekte herkennen en opsporen. Deze menselijke antilichamen vormen
tevens de basis voor de ontwikkeling van therapeutische geneesmiddelen
door Glaucus Proteomics. Het bedrijf is in juli 2000 opgericht in
Utrecht en heeft momenteel 30 werknemers.
Contacten:
Glaucus Proteomics
Erik Baas
+31 (0) 30 656 99 00
Burns McClellan, Inc
Mike Sinclair or Yvonne Alexander
+44 (0) 20 7534 1520
SARA
Marina den Hartog
+31 (0) 20 592 3000
GigaPort Network
Sandra Passchier
+31 (0) 30 230 5305
24 apr 02 09:02